Бактериални растителни болести

Oбобщение

BBSRC, също така от името на Министерството на околната среда, храните и селските въпроси (Defra), Съвета за изследване на естествената среда (NERC) и шотландското правителство, обявява покана за изследване за справяне със заплахите за здравето на растенията и биосигурността в Обединеното кралство от бактериални заболявания. Приканват се предложения за мултидисциплинарни и интердисциплинарни изследвания на бактериални растителни патогени и техните взаимодействия с растения гостоприемници, безгръбначни vectors и по-широката среда.

Тази покана е втората фаза на по-широка програма за бактериални болести по растенията, подкрепена от Фонда за стратегически приоритети на Великобритания за научни изследвания и иновации (UKRI). Той ще допълни работата на наскоро създадения консорциум BRIGIT, фокусиран върху Xylella fastidiosa чрез финансиране на проучвания на различни заболявания.

История

Нараства загрижеността относно потенциалните и съществуващите заплахи за здравето и биосигурността на растенията (включително дърветата) в Обединеното кралство от по-широкото разпространение и по-честата поява както на възникващи, така и на местни бактериални заболявания. Допринасящите фактори включват промяна в околната среда и по-голямо движение на потенциално замърсени растения или растителни материали в търговията. Тези патогени (и техните безгръбначни vectorт) застрашават растениевъдството, горското стопанство, търговското и благоустройственото градинарство, както и горите и по-широкото биоразнообразие в по-широката околна среда. Те имат потенциала да причинят широко разпространени и тежки икономически, екологични и социални въздействия върху ландшафта и екосистемите, както селски, така и градски.

Бактериалните фитопатогени са разнообразни и причиняват много видове заболявания. Предаването им може да бъде по въздушно-капков път, почвено-пренасяно или чрез безгръбначни vectorс. Когато се въведат в нови райони, разпространението им е непредвидимо, но често силно инвазивно. Те трудно се контролират с химикали и, за разлика от много други растителни патогени, често имат голям брой потенциални гостоприемници.

Загрижеността се засилва от относителната недостатъчност на изследванията върху бактериалните фитопатогени, съчетана с наличието на ограничени научни възможности и капацитет за отговор на предизвикателствата, които те поставят. Патогените често са трудни за изследване: инфекцията може да бъде латентна и без симптоми, докато някои патогени са „необратими“ извън техните растителни гостоприемници.

Регистърът на риска за здравето на растенията на Defra съдържа информация за много бактериални патогени и се добавят повече патогени, тъй като те стават риск. Тази покана не се фокусира изключително върху бактериалните заболявания, включени в регистъра, но кандидатите могат да го намерят за полезен източник на информация.

Цел

Целта на настоящата покана за представяне на предложения е да подкрепи мултидисциплинарни и интердисциплинарни изследвания за разбиране и информиране на управлението на заплахите за здравето на растенията в Обединеното кралство от бактериални заболявания с потенциално сериозно въздействие върху култивираните растения или природната среда. Тя има за цел да отговори на нуждите на политиците и практикуващите, като използва научни възможности за отстраняване на пропуски в познанията по биология и епидемиология на тези заболявания, за да оптимизира реакциите за противодействие.

Поканата също така има за цел да увеличи способността и капацитета за изследване на бактериални заболявания чрез обединяване на експертизата в патологията на растенията с най-съвременните геномни и други технологии, както и изследвания в други дисциплини. Когато е уместно, това изследване трябва да се основава на подходящи подходи от други области, особено в по-широк контекст на околната среда, за да се разберат взаимодействията между патогените, техните гостоприемници и vectorи по-широки екосистеми.

Портфолиото от финансирани проекти ще се управлява активно за насърчаване на обмена на знания - между проекти и със заинтересованите страни - с цел да се използват възможностите за синергия и да се осигури уместност за нуждите на потребителите.

Обхват

Тази покана е втората фаза на по-широка програма за бактериални болести по растенията, подкрепена от SPF, с допълнителен принос от Defra и шотландското правителство. Той обхваща всички видове бактериални патогени (включително фитоплазми), които засягат или застрашават културни или други (наземни или водни) растения (включително дървета) с търговско, екологично, социално или културно значение и стойност в Обединеното кралство.

Да разбере биологията на бактериалните патогени и техните сложни взаимодействия с растения гостоприемници, безгръбначни vectorи по-широката среда, предложенията ще трябва да се основават на опит от различни изследователски дисциплини. Те могат да включват бактериология, екология, ентомология, епидемиология, геномика, моделиране, растителна патология, социални науки и всякакви други подходящи области на изследване. Иновативните интердисциплинарни подходи, които интегрират различни видове експертиза, биха били особено приветствани.

Освен че е отлично от научна гледна точка, изследванията, които трябва да бъдат финансирани, трябва да бъдат стратегически подходящи за нуждите на потенциалните потребители: правителство, държавни агенции, бизнес, индустрия и неправителствени организации. Очаква се заинтересованите страни да бъдат ангажирани в проектирането и доставката на проекти, за да се гарантира тяхното значение за политиката и практиката.

Освен това предложенията трябва да демонстрират как те биха увеличили капацитета на Обединеното кралство и способността за изследване на бактериални болести по растенията.

Предлагат се предложения за проекти за справяне с предизвикателства по една или повече от следните теми, но те не са предназначени да бъдат предписващи или изключителни:

Ефекти от промените в околната среда

Промените в околната среда и нейното управление вероятно ще доведат до промени в начина, по който бактериалните патогени се разпространяват и засягат техните гостоприемници. Промени в температурата, моделите на валежите, CO₂ концентрации, насекоми vector поведението, използването на земята и земеделското поведение могат да повлияят на начина, по който гостоприемникът е изложен на патогена, и наистина дали бактериална болест ще се установи след достигане на Обединеното кралство за първи път. Приложенията за изследване на ефектите от променящата се среда върху бактериалните заболявания ще помогнат на заинтересованите страни да разберат и да се подготвят за бактериални заболявания сега и в бъдеще.

Трансфер между хостове

Едно от най-големите опасения относно някои бактериални заболявания е тенденцията им да засягат особено широк кръг от растения гостоприемници. Разбирането не само на набора от гостоприемници на патогена, но и как той може да повлияе на нови гостоприемници, може да ни даде знания, които могат да бъдат използвани за предотвратяване на инфекция на други гостоприемници. Разбиране на ролята на vectorучастващите в предаването на болестта и инфекцията на растенията също ще бъдат ключови за разработването на начини за намаляване на въздействието на тези болести.

Фактори, влияещи върху патогенността

За да може бактериално заболяване да се закрепи в растението гостоприемник, бактерията трябва да срещне гостоприемника във форма, в която може да се случи инфекция. Приложенията са добре дошли, за да разберат жизнения цикъл на патогена и какво го кара да бъде патогенен, както и да разберат как възниква тази патогенност. Това може да изиграе роля за информиране на заинтересованите страни за рисковете от инфекция, включително от вносен растителен материал.

Ефекти на почвите / почвения микробиом

Почвата може да играе различни роли в предаването и установяването на бактериални болести по растенията. Патогенните бактерии могат да живеят в почвата и да заразяват растенията гостоприемници, които растат там, и за разлика от патогените, засягащи горните части на растенията, пренасяните от почвата бактерии са трудни за лечение. В допълнение болестите могат да се разпространяват от организми, живеещи в почвата, като нематоди и охлюви. Условията на почвата, включително почвения микробиом, също могат да имат ефект, но в тази област не са направени малко изследвания и са добре дошли заявления за изследване на ролята на почвата при бактериални заболявания на растенията.

Разбиране на устойчивостта и податливостта на гостоприемника

Изследвани са механизмите, по които растителните гостоприемници се противопоставят на атака от бактериални патогени, но не винаги е ясно защо един вид гостоприемник ще бъде податлив на бактериално заболяване, докато друг вид ще бъде до голяма степен устойчив. Разбирането на устойчивостта на гостоприемника попада в обхвата на тази покана, но заявления, фокусирани главно върху устойчиви на отглеждане сортове култури, ще бъдат отхвърлени.

Изследванията, които трябва да бъдат финансирани, трябва да са в рамките на правомощията на BBSRC и / или NERC и трябва да включват съществен елемент от разследващата биологична и / или екологична наука. Но за да се гарантира тяхната значимост за заинтересованите страни и потенциал за въздействие, предложенията трябва да вземат предвид икономическия и социалния контекст на предизвикателствата, свързани с растителното здраве, с които се стремят да се справят. При условие, че те са тясно интегрирани с други аспекти на предложената работа, проектите могат да включват и подходящи елементи на икономически анализ или социални науки.

Първата фаза на програмата за бактериални болести по SPF е интегрирана мултидисциплинарна работа за £ 5 милиона Xylella fastidiosa от консорциум BRIGIT от институции, ръководен от Центъра на Джон Инес. Докато допълнителни изследвания върху X. досадно не е изключен от настоящата покана, предложената работа трябва да бъде отличителна и допълваща BRIGIT и други съществуващи изследвания, включително проектите XF-ACTORS и POnTE, подкрепени от програмата на Европейския съюз „Хоризонт 2020“. Предложенията трябва да демонстрират добавената стойност, която биха осигурили чрез синергия с текущите дейности.

Предложенията за изследване на ролята на бактериите при болестите на дъбовите дървета се очаква да се приведат в съответствие с приоритетите и да се ангажират с партньорството Action Oak. Defra предложи да предостави писмо за подкрепа на предложения, които отговарят на целите на Action Oak, моля, свържете се със Сара Джефери на info@actionoak.org с описание на вашето предложение за повече информация. 

Изследването по следните теми е изключено от тази покана:

• изследвания върху бактериалното замърсяване / гниене на посевите след прибиране на реколтата
• изследвания с конкретната цел да се даде възможност за търговско отглеждане на растения, устойчиви на определени бактериални патогени
• изследвания за разбиране на взаимодействията между растенията и човешките бактериални патогени и тяхната роля в предаването на болестта на хората.

Мащаб и продължителност на проекта

Налични са до 13 милиона британски лири, в зависимост от качеството на получените предложения, с цел да се подкрепи подходящо широко и балансирано портфолио от до 20 проекта. Заявленията не трябва да надвишават 2.5 милиона британски лири (при 100% от пълните им икономически разходи). Финансиращите се стремят да финансират портфолио от проекти със смесени размери и области на фокус. Мащабните мултидисциплинарни приложения са добре дошли, но не са изключени и по-малки, по-целенасочени проекти.

Средства могат да бъдат поискани за период до три години, а проектите се очаква да стартират до 1 май 2020 г.

Всички проекти ще бъдат финансирани на 80% от пълните им икономически разходи.

Градска среща

На 21 юни се проведе Градска среща, за да се даде възможност на потенциалните кандидати и заинтересованите страни да разберат повече за предисторията на поканата и да разберат какво финансиращите се надяват да подкрепят чрез нея. Презентации бяха изнесени от Джон Найт, Никола Спенс, Саския Хогенхаут и Деби Хардинг и те са достъпни в раздела „Изтегляния“. 

Избираемост

Поканата е отворена за отговарящи на условията лица в организации, които обикновено имат право да кандидатстват за грантове за научни изследвания от изследователските съвети на UKRI. Прилагат се стандартните критерии за допустимост на BBSRC и NERC, вижте изтеглянията и NERC: Допустимост за безвъзмездна помощ за научни изследвания.

Само за това обаждане: Изследователските институции от публичния сектор (PSRE) с 10 или повече изследователи с докторска степен (или еквивалент) могат да кандидатстват. Ако PSRE, които желаят да кандидатстват, преди това не са кандидатствали за финансиране от UKRI и в момента не са определени за статут на IRO, те ще трябва да попълнят формуляр за допустимост (вижте: Изследвания и иновации в Обединеното кралство: Заявление за удостоверителност за кандидатстване в Обединеното кралство за изследвания и иновации за финансиране на научни изследвания), за да се гарантира, че разполагат с необходимия изследователски капацитет, системи и контрол за управление на научните изследвания и безвъзмездно финансиране. Кандидатите за PSRE трябва да се свържат plant.bacteria@bbsrc.ukri.org при първа възможност да обсъдят своите интереси при кандидатстване.

Заявленията, които включват директори или съ-следователи, които нямат право да кандидатстват за финансиране, и / или неправилни организации ще бъдат отхвърлени.

Отвъдморските изследователски институции могат да бъдат партньори за сътрудничество по проекти, но нямат право да получават директно финансиране по инициативата. Предложения за безвъзмездни средства за научни изследвания няма да бъдат приемани от чуждестранни институции или от кандидати от Обединеното кралство, ако предложенията съдържат искания за директно финансиране за чуждестранни съкондиданти (но вижте раздела за подизпълнението по-долу).

Организации от частния сектор, благотворителни организации и неправителствени организации, които нямат одобрен от UKRI статут на IRO, могат да участват като партньори за сътрудничество, но такива организации нямат право да кандидатстват или да получават пряко финансиране от тази инициатива (но вижте раздела за подизпълнението по-долу).

Във всички случаи на съвместна дейност с организации, различни от класовете на допустимите институции, изброени по-горе, както кандидатите, така и сътрудниците / партньорите по проекта трябва да са наясно, че всички направени разходи, преки или по друг начин, от сътрудници или институции на сътрудници (партньори по проекта) във връзка с това с колаборации, не могат да бъдат изпълнени чрез тази инициатива.

Допълнителни указания за включването на сътрудници и партньори по проекта са налични в ръководството за безвъзмездни средства на BBSRC (вижте раздела за изтегляне).

Допустими са аспектите на предложената работа за възлагане на подизпълнители на институции, които нямат право да кандидатстват директно за финансиране, поради липсата на подходящ опит в допустимите институции. Заявителите обаче ще трябва да докажат, че участието на който и да е подизпълнител ще осигури достъп до основни възможности, които не са лесно достъпни в допустима британска изследователска организация. Подробна информация за възлагането на подизпълнители е в Ръководството за безвъзмездни средства на BBSRC.

Разписание

Предварително обявяване на повикването	4 март 2019
Стартиране на разговора	20 май 2019
Градска среща	21 юни 2019
Краен срок за кандидатстване	25 юли 2019
Среща за оценка	Декември 2019 г. (tbc)
Отпуснати грантове за научни изследвания	Февруари 2020 г. (tbc)

Има ограничения за продължителността на тази програма за финансиране и всички безвъзмездни средства ще трябва да започнат на или преди 1 май 2020 г.

Процес на кандидатстване и оценка

Заявленията за безвъзмездни средства за научни изследвания трябва да се подават чрез системата за съвместно електронно подаване (Je-S) на научните съвети и тяхната оценка ще се управлява от BBSRC. Потенциалните кандидати трябва да отбележат, че отговарящите на условията лица и институции трябва да бъдат регистрирани в системата Je-S, за да могат да кандидатстват. Всяка отговаряща на условията институция или лице, което обмисля подаване на предложение, но в момента не е регистрирано за използване на системата, трябва да обмисли ранна регистрация и да се свърже с бюрото за помощ Je-S (jeshelp@je-s.ukri.org ; 01793 444164).

Кандидатите трябва да влязат в Je-S и да изберат:

• Съвет: BBSRC
• Тип на документа: Стандартно предложение
• Схема: Стандартна
• Обаждане / Тип / Режим: Програма за бактериални растителни болести Фаза 2

За тази покана ще е необходим допълнителен документ „План за ангажиране на заинтересованите страни“. Моля, качете това във вашето приложение като тип прикачен файл „Друг прикачен файл“ в Je-S. Всички останали документи се изискват според стандартните приложения, но за тази покана ограничението на страниците за Case for Support и Track Record трябва да бъде максимум дванадесет страни на A4 (включващо две страници от протокола и десет страници от Case за Поддържа).

Заявленията трябва да се подават преди 16:00 BST в деня на крайния срок за кандидатстване. Не се приема удължаване на сроковете. Препоръчваме ви да подадете доста преди крайния срок за кандидатстване.

Критериите за оценка на предложенията ще бъдат както следва:

• Научни постижения
• Уместност за обхвата и целта на обаждането
• Икономическо и социално въздействие
• Уместност на стратегията и политиката
• Съотношение качество-цена
• Потенциал за изграждане на капацитет и капацитет
• Ангажиране на заинтересованите страни
• Устойчивост и целесъобразност на плана за управление на проекта, по-специално за управление на интердисциплинарни консорциуми.

Финансиращите ще вземат окончателното решение за проектите, които ще бъдат финансирани въз основа на препоръките на оценителната комисия. Финансистите ще вземат предвид и общото покритие и баланс на програмата за работа, която се финансира.

Пътища за въздействие

Кандидатите ще трябва да попълнят изявление „Pathways to Impact“ като част от заявлението си; това е стандартно изискване на заявленията за безвъзмездни средства на Съвета за научни изследвания, което се разглежда като част от процеса на партньорска проверка. Финансиращите партньори искат изследователите, финансирани чрез тази програма, да планират програма за ангажиране на заинтересованите страни и обмен на знания, която да бъде приложена през целия живот на техния проект. Кандидатите трябва внимателно да обмислят как знанията и опитът, придобити от проекта, ще бъдат предоставени на съответните политици и други заинтересовани страни. Всички други видове въздействие, които могат да възникнат от изследването, също трябва да бъдат включени. Моля виж Изследвания и иновации в Обединеното кралство: Пътища за въздействие.

Кандидатите трябва да отбележат, че разходите, свързани с изпълнението на специфични за проекта дейности за въздействие, могат да бъдат включени в заявленията за безвъзмездни средства. Разходите трябва да бъдат напълно оправдани. Финансистите са особено заинтересовани да видят дейности по въздействие, които ще надхвърлят живота на безвъзмездните средства за научни изследвания.

Ангажиране на заинтересованите страни

В допълнение към документа Pathways to Impact, кандидатите ще трябва да представят план за ангажиране на заинтересованите страни. Финансистите искат да видят активно участие на съответните групи от заинтересовани страни в проекти, от проектирането на проекти, до провеждането на проучването и в крайна сметка, като заинтересованите страни използват резултатите от изследването. Планът за ангажиране на заинтересованите страни трябва да посочва кои заинтересовани страни ще / вероятно ще бъдат включени, как те ще бъдат включени в проекта и как техните текущи нужди ще бъдат отразени при изпълнението на проекта.

Планът за ангажиране на заинтересованите страни ще бъде отделен прикачен файл от документа Pathways to Impact и ще бъде с дължина до две страници.

Джон Найт от AHDB е предложил да действа като посредник за насърчаване на сътрудничеството между кандидатите и съответните заинтересовани страни от индустрията; моля, свържете се с Jon.Knight@ahdb.org.uk за повече информация. 

Изисквания за финансиране и докладване

Финансирането, отпуснато по инициативата, ще се администрира от BBSRC. Той ще бъде предмет на стандартните условия на UKRI за безвъзмездни средства за научни изследвания (вж. Изтегляния), заедно със специфични допълнителни или алтернативни изисквания, договорени съвместно от BBSRC и неговите партньори по финансиране (напр. Свързани с интелектуалната собственост, управлението и споделянето на данни, изискванията за докладване, публичното участие или взаимодействие с партньорството за финансиране).

Проектите, подкрепяни чрез тази инициатива, ще бъдат с продължителност до три години.

Проектите ще бъдат финансирани при 80% от допустимите пълни икономически разходи (FEC) в съответствие с обичайната практика на изследователските съвети.

Финансистите са приели политиката на UKRI за отворен достъп до констатации от научните изследвания (виж: Изследвания и иновации във Великобритания: Политика за отворен достъп) и безвъзмездните средства ще бъдат финансирани при тези условия. Разходите за публикуване вече не са допустими разходи за безвъзмездни средства от изследователски съвет.

Ще се прилагат стандартните изисквания за отчитане на безвъзмездни средства за научни изследвания, отпуснати съгласно условията на безвъзмездните средства на UKRI.

Заявленията ще бъдат достъпни за всички финансиращи; информация за финансираните безвъзмездни средства ще бъде достъпна на уебсайтовете на финансиращите.

Контакти

Деби Хардинг

plant.bacteria@bbsrc.ukri.org