Въпроси и отговори с Лука Ванджохи: Постигане на повече с по-малко, силата на статистиката

Лука Ванджохи е регионален сътрудник за управление на знания в Международния център за картофи в Уганда и работи с проекта Sweetpotato Genetic Advancement and Innovative Seed Systems (SweetGAINs). Той разговаря със специалиста по регионални комуникации Вивиан Атакос за това как статистиката подхранва пробивите в растениевъдството, като рационализира начина, по който се събира и споделя информацията.

Въпрос: Когато човек мисли за размножаването на растения, статистиката и събирането на данни не са непременно първото нещо, което му идва на ум. Каква роля играе управлението на данните при разработването и приемането на подобрени сортове растения?

ЛУ: Данните могат да се разглеждат като сърцевина и душа на изследователската дейност. Sweet GAINs работи в различни страни с различни партньори, всеки има различен начин за събиране на данни и управление на своите изследователски дейности. Необходими са правилни и много стандартизирани дейности по управление на данните, за да сме сигурни, че ще успеем да използваме данните, за да вземаме решенията си за избор. Развъдчиците на растения разчитат на данни, за да вземат добри решения за подбор. Преди да бъде пуснат сорт, ние искаме да разберем какво заместваме. Защо смятаме, че е необходима нова сортова версия в една държава.

Q:  Какви са рисковете да не се систематизират данните, генерирани от съвременна развъдна програма?

ЛУ: Ако не събираме нашите данни и не дефинираме чертите, които събираме по стандартизиран начин, тогава ни е трудно да споделяме данни. Ще откриете, че когато нямате систематичен начин за управление на вашите данни, тогава хората, които не са били там, когато тези данни са били генерирани, може да се затруднят да работят с тези данни. И накрая, не систематизирането на вашите данни означава, че рискувате да въведете много грешки, да загубите данни или да съберете повредени данни. Това ви прави много трудно да използвате тези данни, без да правите това, което ние наричаме избиране на данни - скъп и досаден процес. Дори след курирането някои данни ще бъдат загубени или неизползваеми.

Стандартизирането на събирането и управлението на данни помага на селекционерите на растения да надграждат работата си взаимно. В миналото събирането на данни не е било стандартизирано от проект на проект и от обект на обект, което е водило до погрешно тълкуване или скъпоструващи загуби на време (снимка: Изабел Кортие/CIP)

Въпрос: Защо е важно да се приложат стандартни оперативни процедури за управление на данните в растениевъдството?

ЛУ: Явните предимства, които виждаме по отношение на прилагането на тези стандартни оперативни процедури (SOP), са, че сме в състояние да установим ясни стандарти за висококачествени данни по отношение на начина, по който правим нашите пробни проекти. Нашият подход към дигитализацията се занимава с това как събираме данни, какво подобрено оборудване използваме и т.н. Другата полза е, че гарантираме, че данните, които събираме, са сравними данни днес и утре в различните среди и държави, в които работим.

Въпрос: Какви са предизвикателствата от нестандартизирането на данни в дадена програма?

ЛУ: Ако искаме да направим съвместен анализ в бъдеще, се нуждаем от стандартизирани системи за именуване. За да различим напреднал опит от предварителен процес, използваме същата онтология. Например, преди време искахме да разгледаме как болестта от сладък картоф ретровирус засяга нашите растения, но това беше предизвикателство, защото в миналото една група можеше да отбележи точки по скала от едно до пет, въз основа на тежестта на ефекта от вирус върху растението. Тогава щяхме да намерим друга програма, отбелязана по скала от едно до три, а друга ще използва система за оценяване от един до девет. Когато говорим за онтологията, ние стандартизираме тези резултати, така че те да са еднакви в различните програми. Също така използваме BreedBase за централизиране на съхранението на всички наши данни и ни дава възможност да проследяваме пробни данни през различни (програмни) преходи и да изберем потенциални проблеми в началото на нашата работа, вместо да открием, че сме събрали или съхранили грешни данни точно в когато искате да направите анализ.

Q:  Как събирането и управлението на данни помага на животновъдите да се насочат към предпочитани черти, да рационализират работата си и да намалят общите разходи?

ЛУ: Ефективен процес на управление на данни подпомага животновъда в бързото, рентабилно събиране на данни, което им позволява да събират много данни, да ги анализират и да вземат решения за подбор, за да подкрепят работата си. Животновъдите обикновено работят с много присъединявания. Виждал съм опити в Уганда, където сюжет имаше около 7000 записа в процес, който включва 7000 сюжета. Когато имате голям брой присъединения, искате да можете да влезете, да съберете данните си бързо и по ефективен начин. Включването на процес, който ви позволява да направите това цифрово, избягва хартиени записи, които рискуват от грешна транскрипция на данни по време на цифровизацията. Нашите инструменти имат вградени проверки, за да се уверим, че събираме правилните данни или ограничаваме възможно най-много въвеждането на данни. Само допустимите стойности, които могат да бъдат, които могат да бъдат събрани. Това дава възможност за бърз анализ на данните, тъй като те вече са цифровизирани и за бързо лесно споделяне с колеги и други хора, които помагат при анализа на данните.

Въпрос: Разкажете ни как използването на баркодове помага за рационализиране на информацията.

ЛУ: От известно време използваме много етикети с баркод. Програмите се насърчават да отпечатват етикети за своите материали в екранировките и на полето. Същността на баркодирания етикет е да може да се проследява движението на дадено присъединяване или даден генотип в различни работни области. BreedBase, нашата база данни, генерира уникален идентификатор за всеки парцел, който издавате в полето, и ние го поставяме върху баркода, така че можем да проследяваме ефективността на даден запис от полето до реколтата и кога носим го в лаборатория за анализ и така нататък.

В: Какъв съвет имате за други организации, които искат да внедрят стандартните оперативни процедури в своите развъдни програми?

ЛУ: Научихме, че нашите SOP са жив документ. Необходимо е развитие, защото след като имате справочен документ, за хората става лесно да се върнат и да го разгледат и да подкрепят хора, които са разпръснати из целия регион. Моят съвет към другите би бил, че развитието трябва да бъде, то трябва да бъде неразделна част от дейностите, които правите днес. Започнете от малко, документирайте процедурите, както са днес. Итератирайте с развъдните екипи, с хората, които всъщност изпълняват развъдните дейности и се стремят непрекъснато да подобряват този документ. Не се стремете да имате готов перфектен документ. Започнете с писане на един и след това чрез съвместните усилия на всички от екипа погледнете да уловите всички процеси и всички рутинни дейности в развъдната програма. Така че с течение на времето ще имате документ, който е възможно най-приобщаващ и включва всички дейности, които предприемате в програмата си.

Посетете ни на SoundCloud, за да слушате Подкаст SweetGAINS с участието на Лука Ванджохи и други учени, модернизиращи развъждането на растения.